Après des études en architecture à l'Université Carleton d'Ottawa et à l'Université Technique de Berlin, il exerce son métier d'architecte pendant quelques années en Allemagne. En 1997, il entame une collaboration avec le compositeur Emmanuel Madan sous le nom de [The User] et produit trois séries majeures de pièces intitulées Symphonie pour imprimantes matricielles (Symphony for dot matrix printers), Silophone et Coincidence Engines. Depuis 1998, leurs pièces et la série Ondulation signée McIntosh ont été abondamment distribuées et présentées un peu partout dans le monde. Thomas McIntosh est lauréat de deux prix du Festival de Nouveau Cinéma et Nouveaux Médias de Montréal ainsi que d'une mention honorable du festival Ars Electronica. McIntosh et Madan ont été en nomination pour le prix Nam June Paik en 2004 et finalistes des prix Quartz à Paris et Transmediale à Berlin en 2010.